直接冷却将蒸发管安装在冷藏库房内,液态冷却剂经过蒸发管时，直接吸收库房内的热量而降温。
间接冷却是由鼓风机将库房内的空气抽吸进空气冷却装置，空气被盘旋于冷却装置内的蒸发管吸热后，再送入库内而降温。空气冷却方式的优点是冷却迅速，库内温度较均匀，同时能将贮藏过程中产生的二氧化碳等有害气体带出库外。
疫苗冷库制冷控制系统采用全自动微电脑电气控制系统，智能电脑温度控制，高精度温度传感器，全自动温度恒温，地洞开关机，具有自动报警，无需人工操作，数码温度显示，可选配温湿度记录仪，确保库内物品存放。
疫苗冷库制冷机组选用进口压缩机，具有能效比高，制冷能力强，噪音低可靠特点。冷凝散热器配用风冷冷凝器，选用外转子低噪音电机，能有效散发热量，在极端高温环境下使高压压力维持在正常值，使制冷机组发挥制冷效果，节能环保。冷库内蒸发器采用吊顶冷风机。
冷库火灾的特点
1. 传统探测器无法使用
传统火灾探测器不适合安装在冷库内部，由于冷库内部温度过低，会造成探测器结霜或故障。
2. 火灾隐患多
空调制冷设备、货物传输设备、照明设备等电气或机械故障，聚苯乙烯泡沫保温材料，塑料包装材料，木制栈板充斥在冷库内部。冷库内温度非常低，长期造成电缆线塑料外皮变脆而容易破损，进一步造成线路短路而燃烧，且冷库内空气异常干燥，起火后燃烧非常迅速。
3. 火灾扑灭困难
冷库内部空间封闭烟雾久聚不散，大火沿着保温材料蔓延燃烧，内部空间大，货架多，水枪难以对起火点冷却灭火。
冷库排除异味的方法 臭氧法。臭氧具有强烈的氧化作用，不但能消除冷库库房异味，还能制止微生物的生长。采用臭氧发生器，可实现对库房异味的排除。 若冷库内存放含脂肪较多的食品时，则不宜采用臭氧处理，以免脂肪氧化而产生酸败现象。
甲醛法：将冷库库房内的货物搬出，用2%的甲醛水溶液（即福尔马林溶液）进行和排除异味。
食醋法：装过鱼的冷库库房，鱼腥味很重。不宜装其它食品，非得经彻底清洗排除鱼腥味后方可装入其它食品。一般清除鱼腥味的方法是采用食醋的方法。