水温也是鱼病发生的重要因素，水温高低与疾病的发生和流行有密切的关系。一般病毒和疾病发在水温为25℃-30℃时传染性强，32℃以上和18℃以下时感染减弱。而有些疾病，如水霉病、小瓜虫病、斜管虫病和鱼波豆虫病通常在20℃以下发病，属于低温季节流行病。

养鱼的水域有以下几大类：大中型水库和湖泊；小型水库、湖泊和池；稻田；较小、较浅的流水鱼池和室内小型养鱼池。水库是水利部门为蓄水灌溉和防洪抗涝而修建的水利设施，大多建在河流上游。

水温是影响鱼类摄食和生长的因子。一般来讲，鱼类在1-33℃水温中都能生长，10-15℃为弱度生长期，15-24℃为一般生长期，20-32℃为适宜生长期，24-30℃为适生长期；水温超过32℃，鱼类摄食明显下降；水温超过33℃，鱼类停止生长；水温超过36℃，鱼类开始死亡。草鱼在27-30℃摄食旺，低于20℃，生长速度明显下降；鲤鱼在23-29℃摄食旺，低于15℃生长受到抑制。

我国的湖泊多在江河中、下游，是由江河冲积和泥沙堰塞而成的静水水体。水深一般在2-6米，上、下层水温比较接近。湖泊有大、中、小之分。根据湖泊成因、生物量多少和肥沃程度，湖泊可分为富营养、中营养和贫营养型三种类型。