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北京大学肿瘤医院有国家重点学科1个(肿瘤学)、国家临床重点专科2个(肿瘤科、病理科)、北京市重点学科4个(北京市胃癌防治中心、北京市乳腺癌防治中心、北京市影像介入中心、超声诊断中心)、北京市中医管理局重点学科1个(中西医结合科暨老年肿瘤科)，全国名老中医药专家传承工作室1个，北京学者工作室2个，是恶性肿瘤发病机制及转化研究教育部重点实验室、恶性肿瘤转化研究北京市重点实验室。

北京大学肿瘤医院现有工程院院士1名、长江学者奖励计划特聘教授2名，自建院以来先后有3人获国家自然科学基金杰出青年、11人获突出贡献专家，38人获政府特殊津贴。现有教授39名、副教授 64名、博士研究生导师50名、硕士研究生导师 62名。

医院自成立以来，致力于胃癌、乳腺癌、肺癌、结直肠癌、肝癌、食管癌、恶性淋巴瘤、恶性黑色素瘤、泌尿系统肿瘤、妇科肿瘤、头颈部肿瘤、骨肿瘤、软组织与腹膜后肿瘤等各种肿瘤的诊断和综合。其中胃癌的研究两次获得了国家科技进步二等奖。

研究所建所以来，在肿瘤学基础理论研究、常见主要肿瘤的临床诊断与、胃癌、食管癌高发区现场的预防干预研究等领域均有创新与的成绩，在国内外颇具影响。

北京大学肿瘤医院是全国肿瘤学博士学位授权点和博士后流动站。医学教育涵盖本科生、硕士生、博士生、博士后以及进修生、职工的继续教育。每年定期举办全国临床肿瘤医师进修班和国家继续教育项目全国性学习班。

北京大学肿瘤医院与许多国际知名肿瘤研究机构建立了密切的合作关系，每年不断有国内外专家学者来院参观、考察、讲学，进行科研协作与学术交流。医院也不断有科研、临床、医技专业人员出国访问、进修、短期工作或参加国际学术会议。

北京大学肿瘤医院以建设患者的国际化肿瘤集团中心为自己的发展愿景，坚持内生式发展、外延式增长两个发展方向，实施国内前列、国内、国际知名三个发展阶段，采取过硬的品牌学科、的管理团队、的专家队伍、人性化的医院文化思想四项发展措施，让每一位肿瘤患者在就医中获益。