一、原核细胞在整体上，原核细胞可通过改变核糖体结合位点（RBS）序列或者在RBS邻域制造二级结构来阻止小亚基和mRNA的结合进而阻止翻译的起始。一方面由于RBS序列固定，改变其序列将会造成所有mRNA停止翻译。另一方面由于改变序列并非快速准确的调控方法，针对单个转录本，原核细胞倾向于采取以下几种方式进行调控：
（1）蛋白依赖的——通过蛋白质特异性结合到RBS和起始密码子AUG之间的序列以通过物理方式阻止小亚基和mRNA结合，但该特异性序列不能包括RBS（否则将可能会导致所有转录本停止翻译）。
（2）mRNA依赖的——通过ORF和下游序列的杂交来阻止该ORF的起始。但如果该ORF上游有其他开放起始位点，则该ORF可以被上游翻译启动（核糖体翻译到下游时，将其解旋），这样的好处是当且仅当个ORF翻译时，第二个ORF才可以翻译。