进料加工贸易的进口，其大体的程序差不多。不同的是要先办手册。（关于手册的办理有空再另辟主题）分为进料加工手册和来料加工手册。报关的时候要用加工贸易的手册，再加上一般贸易几口所需的资料进行报关。
再就是缴关税，因为有手册，所以如果你进口的货物是免税的，只缴保证金，有的是需要缴全额的也就是的保证金，有的只缴100元的保证金。这些保证金等你的手册上面的所有进口料件核出口成品都出完了，那就要核销，核销完了你缴的保证金会一分不少的退回给你。和一般贸易所交的关税的操作程序一样。只不过一个是关税，一个是保证金。
注意事项
1.进口报关单证（装箱单，发票，贸易合同）等所有单证一定根据实际货物一致
2.装箱单，发票，贸易合同等单证上的货物品名一定要一样并且和实际货物的品名一致
3.装箱单上的货物重量和方数要和提单上的一致，并且要和实际货物一致
4.合同上面要有合同号，发票上面要有发票号
5.是木质包装的需要在木质包装上有IPPC标示
6.从韩国和日本进口货物，还要有非木质包装证明.
7.凡进口下列九类商品必须提前5天预申报：
汽车零件;化工产品;高科技产品;机械设备;药品;多项食品;多项建材;钢材;摩托车零配件。
8.凡进口旧印刷机械，进口年限不能超过10年，超过10年国家不允许进口
9.凡进口发电机组，工作实效不能超过15000小时，年限不能超过8年
10.旧医疗器械，国家不允许进口
查验：税金交纳后等待海关的进一步指示。海关如需查验货物，则由报关员和海关官员共同查验，查验合格后，货物方可放行。送货：根据进口商的要求，货运代理可派车将货物送至指定地点。成本核算：在此票货物顺利清关并抵达进口商指定地点后，进行后期成本核算。货运代理进口报关发生的费用如下：运输费、报关费、代垫税金、操作费、仓储费等。
进口报关是履行海关入境手续的必要环节之一。进口报关严格按照国家法律要求进行相关操作，需要明确相关资料等。进口报关是指收货人或其代理向海关申报进口手续和缴纳进口税的法律行为。海关根据报关人的申报，依法进行验关。海关经查验无误后，经收货人或其代理缴纳相关税款后，才能放行。