预付款银行保函是指以银行信用为担保，由银行向甲方出具的担保函，但乙方违约时，由银行向甲方进行赔付。目前，预付款银行保函主要是建设银行开具，支持全国使用。也有部分甲方要求必须为当地银行开具的，这种情况可以通过担保公司代为办理。同时，部分项目会要求采用基本户所在银行开具的保函，如果基本户所在银行不提供银行保函办理业务，可以通过担保公司代为办理。
一般来讲，银行办理投标保函时需要保办理单位具有同样额度的授信或者是现金存款，而企业往往不具备这些条件。不具备这些条件的企业可以通过代办银行保函的担保公司来进行办理。通过担保公司办理银行保函的流程是：
1、电话或在线咨询担保公司
2、提供营业执照和招标文件
3、担保公司人员确认保函格式和开盘时间以及费用
4、出函并提供保函扫描件
5、快递原件
根据《办公厅关于清理规范工程建设领域保证金的通知》的要求：一、清理各类保证金。对建筑业企业在工程建设中需缴纳的保证金，除依法依规设立的投标保证金、履约保证金、工程质量保证金、农民工工资保证金外，其他保证金一律取消。对取消的保证金，自本通知印发之日起，一律停止收取。二、转变保证金缴纳方式。对保留的投标保证金、履约保证金、工程质量保证金、农民工工资保证金，推行银行保函制度，建筑业企业可以银行保函方式缴纳。
第三，风险评估。就贸易履约保函而言，担保银行主要考察卖方的供货能力，包括但不限于以下几方面：经营状况是否稳定，历史交易记录是否良好，订单产品的生产工艺是否成熟，原材料采购渠道是否可靠，订单额是否在正常的营业额范围内。就工程履约保函而言，担保银行主要考察承包商的施工能力，包括但不限于以下几方面：是否具有相关业务资质，是否有承揽同类工程的经验，机械设备和劳务派遣是否有保障，是否有充足的周转资金，与分包商的合作是否顺畅。需要说明的是，建筑工程比较复杂，很多问题并不是承包商可以自主掌控的，因此担保银行在开立保函前还应对项目设计方案、项目总体预算、业主支付工程进度款的能力、项目所在国别的政策环境等因素进行综合评估，审慎控制风险。