支付保函：是应业主（买方）申请，向施工方（卖方）提供保证担保，在施工方（卖方）按合同正常提供货物、相关服务或完成约定工程量后，如业主(买方)不按约定支付合同款项，则担保方接到施工方（卖方）索赔通知后代为支付相应款项。
保函有什么作用呢？
在采购、工程等项目上体现的比较多。一般的工程项目，甲方为了保障自己的权益，都会要去中标的公司，在签订合同以后，先交一部分保证金到甲方账户，以后一旦发生纠纷，自己的损失会少一点。但是对于一个公司来说，流动资金会关系到公司项目的进度，一般不愿意把大额的钱给到甲方，这个时候就可以通过保函的形式，用保函替代现金交给甲方。保函的出现对于双方其实是一个双赢的事情，甲方利益有保障，乙方也有足够的流动资金运作公司，所以现在很多需要保证金的项目都愿意开具保函，这不限制于工程项目，也包括了采购、招标等等。
海关风险保证金保函：是指企业在开展加工贸易业务中需要向海关缴纳风险保证金时，向银行申请出具以海关为受益人的保函业务。
而保函就是利用第三方担保单位在市场的商业信用来对项目双方进行履约约束，在有第三方担保介入的交易当中，第三方担保会派出专业的风控，法务团队来进行交易双方的调控，保证甲方不出现以骗取保证金为目的的交易，也保证了一方不出现主观性的违约。当甲乙双方信任度不足以达成合作时，第三方担保的介入可以使得甲乙双方依靠第三方担保的商业信用进行新一轮的友好合作