昆山市的POS机申请方法步骤如下：

1. 按照当地银行要求提供相关证件资料，包括营业执照、税务登记证、组织机构代码证、法人身份证件等；

2. 通过银行柜台或网上银行等渠道，向银行提交POS机申请表和资料；

3. 银行会对申请材料进行审核和核实，如有不符要求的地方将通知申请人进行修改和补充；

4. 申请审核通过后，银行将发放POS机，并对使用方法和相关费用进行说明；

5. POS机安装上线后，申请人需要使用银行提供的相关软件进行操作和管理。

商户在查询POS机费率时可以通过多种途径获取信息。一种方式是直接联系POS机服务商，咨询他们的费率政策。服务商会根据商户的具体情况提供相应的费率方案，商户可以根据自己的需求和经营状况选择合适的POS机费率。

在进行POS机费率比较时，商户需要考虑多个因素。首先是费率的具体数值，不同服务商的费率可能会有较大的差异。商户应该根据自己的交易金额和预期交易笔数来计算费率对经营成本的影响，选择一个合理的费率。

除了费率数值，商户还应该考虑费率的计算方式。有些服务商可能会采用不同的计费规则，如按交易金额、按交易笔数、按月销售额等等。商户需要根据自己的交易模式选择一个计费方式更为灵活和适合的服务商。