北京大学肿瘤医院胃肠肿瘤中心二病区拥有的胃肠肿瘤诊疗和研究团队，比肩国际胃肠诊疗中心。共开放床位29张，专长于进展期胃肠肿瘤的手术和综合、早期胃癌的保留功能手术、低位直肠保肛手术等。主治病种包括胃癌、结直肠癌、胃肠道间质瘤和其他少见胃肠道肿瘤。在多学科讨论的基础上，为每一位患者制定和实施为合理的诊疗规划。在中心主任季加孚院长的直接领导下，科室秉承北京大学肿瘤医院的优良传统，追求，不断进步，在临床、科研、教学等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持稳健、严谨工作作风的同时，走上了高速发展的快车道。科室人员结构：1、人员构成：主任医师3人，副主任医师6人，主治医师7人，住院医师2人，护理人员17人。2. 科室主要领导：胃肠肿瘤中心主任季加孚，科主任步召德，护士长赵旻。
科室特色包括：微创手术、外科、疑难手术、功能保留手术、快速康复、病人全程管理。
胃肠肿瘤中心三病区是以消化道肿瘤为主要病种，特别是对结直肠肿瘤的，科室长期以来，坚持以“病人为中心”，消化道肿瘤，特别是综合方面积累了丰富的经验。科室主任顾晋教授现任中华肿瘤学会全国副主任委员，中国协会大肠癌专业委员会副主任委员，并为美国外科学院外籍会员（FACS）。在结直肠癌的方面积累了丰富的经验，科室坚持多学科联合查房，每周进行包括肿瘤影像，肿瘤内科及放疗科，病理科等多学科会诊，坚持为病人带来符合国际规范的综合。对胃癌的综合规范化也具有相当的经验。科室现有主任医师3名，副主任医师3名，主治医师3名，住院医师2名，高年医师均具有留学经历，大多具有博士、硕士学位。科室承担国家及省部级多项科研项目，每年在国际知名杂志上发表多篇专业论文。胃肠外二科注重瞄准国际消化外科发展前沿，与世界多个知名的结直肠外科中心建立联系，包括美国，法国，英国等多个国家的知名专家均曾多次莅临我科进行学术交流，胃肠外二科近年来所取得的成绩也得到国际同行的认可。
乳腺癌预防中心提供乳腺肿瘤诊断及方面的医疗服务。本中心于1998年在北京市重点学科专项资助下组建。2004年结构调整，成为具备乳腺肿瘤诊治功能的一级临床科室，功能涵盖乳腺癌筛查，乳腺病变的诊断，原发性乳腺癌、随访及康复指导，复发性乳腺癌，同时开展相关临床与基础研究。
2021年科室医生总人数30人，正高职称人数6人，副高职称人数8人，中级职称人数13人，初级师人数3人。按学历划分：博士21人，硕士4人，本科4人，专科1人。科室主任：欧阳涛，副主任：范照青、何英剑。护士长：于新颖、徐京燕、孙红娟。
本中心由门诊诊室4间、住院床位64张、门诊穿刺室、超声影像诊断室等部分组成。
“依据循证医学原则，结合研究成果，提供规范的、专业化的医疗服务，保障乳腺肿瘤的总体疗效”是“中心”的任务，“提供高品质的医疗服务，做出有指导意义的研究成果”是“中心”团队追求的目标。
北京大学肿瘤医院淋巴瘤科是我国成立早的淋巴瘤专业科室，经历了36年的发展历程，已经成为我院的特色品牌科室之一，目前拥有普通病床36张，移植舱位4张，专业从事淋巴瘤的临床诊断与、以及自体干细胞移植。收治患者全部为各类型淋巴瘤患者，几乎涵盖世界卫生组织淋巴瘤分类的全部亚型。
我科现有临床医生12人，其中正副主任医师7人、主治医师4人、住院医师1人;护士20人，专业科研人员和技术员各1人，科研护士2人。每年门诊接诊4000人次，新收治住院淋巴瘤患者400例，每月出院患者约200人次。
为了给患者提供更好的个体化综合诊治平台，2005年，以淋巴瘤科为主成立了院内淋巴瘤专业协作组，包括淋巴瘤内科、病理科、外科、放疗科、影像科、核医学科等等，对疑难病例进行全院会诊讨论。
在繁忙的日常工作之外，为了提高淋巴瘤的水平，促进学科发展，也为了给患者提供更多的机会和措施，我科先后承担了30余项国内外新药临床研究。同时作为医院品牌科室和国内少数淋巴瘤专业科室之一，承担了大量北京及外省市疑难病例会诊工作和学术讲座;承担北京大学医学部硕士、博士研究生及住院医师、进修医师、访问学者的部分培训工作;定期为患者及家人举办康复课堂教育活动等等。
感谢患者及家人的支持和理解，也感谢国内外同道的关注和鼓励，淋巴瘤科将继续秉承我院“院有品牌、科有特色、人有专长”的办院宗旨，为来自国内外的淋巴瘤患者提供优质规范的医疗服务和人性化的关怀照顾。