履约保函和保证金的区别在于履约保函在办理的时候手续非常的繁琐，但是在保函当中会有一个明确的有效期，在到了这天之后，乙方的钱就会自动从银行获得自由，而不需要甲方同意或者是不同意。 而办理履约保证金的话，那么总体的手续就比较简单了，只需要直接交钱给买方或者是是交易中心，就能够对于我们的合同进行现金的保障，但是履约保证金只能够保证合同的正常进行，到了约定时间之后，我们的本金并不是能够马上就收回来的。 因此，双方选择履约保函是一个比较明智的选择。
银行履约保函分为两种形式： 1、无条件银行保函； 银行见票即付，不需业主提供任何证据。业主在任何时候提出声明，认为承包商违约，而且提出的索赔日期和金额在保函有效期的限额之内， 银行即无条件履行保证，进行支付，承包商不能要求银行止付。当然业主也要承担由此行动引起的争端、仲裁或法律程序裁决的法律后果。 对银行而言，他们愿意承担这种保函，既不承担风险，又不卷入合同双方的争端。 2、有条件银行保函。 银行在支付之前，业主必须提出理由，指出承包商执行合同失败、不能履行其业务或违约，并由业主或监理工程师出示证据，提供所受损失的计算数据等。 一般来讲，银行不愿意承担这种保函，业主也不喜欢这种保函。
预付款保证担保是指由保证人为承包商向业主提供的，保证人对承包商履行扣还预付款义务的保证。以防止承包商在收到业主的预付款后将款项挪作他用或宣布破产等。预付款担保可采用银行保函、专业担保公司的保证的方式。承包商履约担保的有效期应当在保证合同中约定。保证合同约定的有效期截止时间为工程建设合同约定的工程竣工验收合格之日后的30天至180天。预付款担保的担保金额一般为合同价格(中标价格)的10%-30%。
把保函与跟单信用证相比，当事人的权利和义务基本相同，所不同的是跟单信用证要求受益人提交的单据是包括运输单据在内的商业单据，而保函要求的单据实际上是受益人出具的关于委托人违约的声明或证明。这一区别，使两者适用范围有了很大的不同，保函可适用于各种经济交易中，为契约的一方向另一方提供担保。另外，如果委托人没有违约，保函的担保人就不必为承担赔偿责任而付款。而信用证的开证行则必须先行付款。