北大六院建立了以院士、长江学者、国家杰出青年基金获得者、“973”计划首席科学家、教育部新世纪人才、国家青年科学基金获得者、博士研究生导师等为学术带头人、中青年科研人员为骨干的临床及基础研究队伍，形成了以心身医学、生物精神病学、社会精神病学、儿童精神病学、临床精神病学、精神药理学六个领域为方向的科研团队。历年来我院承担多项国 家级、省部级和国际合作项目，并获多项重大科研奖励。
在精神药理学研究领域，药理研究室结合基础与临床资源，开展精神疾病的新药研发、病理机制及其临床学研究工作。在情感障碍研究方向，采用先进的分子遗传学、神经生物学、精神药理学及功能影像学等技术或理论，对情感障碍进行系列开拓性研究，并取得重要成果。
北京大学第六医院精神科的刘琦教授透露，根据国内的数十项研究估计，每1000个中国人中，有16个人患有重性抑郁障碍。在一年里，每1000个中国人中，会有23人患此病。值得特别关注的是，农村人口患有重性抑郁障碍的可能性（2.0％）高于城市人口（1.7％） ，女性患有重性抑郁障碍的可能性（2.3％）高于男性（1.4％）。
从实习医生到主任医师，刘琦医生已经在北大六院工作了二十多年。每日查房看患者、调整方案、日常带教、出门诊以及作为科室副主任承担一些科室管理工作，她的工作十年如一日。病房的住院医三个月或六个月轮转一次，经她带教的住院医也有几百个了，几乎没有住院医不喜欢她。