由于起初从医就是为了白血病，所以在入院初期，傅佩芬了血液科，但是却因缘际会被分配至医院的普外科。在普外科，傅佩芬对肝胆胰、胃肠及甲状腺、乳腺疾病等都产生了浓厚的兴趣。出于自身的女性身份，很快她将目光准确锁定至乳腺领域。
傅佩芬用“天差地别”来形容30年前的乳腺癌就诊流程。“总体来说，诊断方法、手术方式及术后都很单一”，傅佩芬回忆。其一是诊断方法。上世纪90年代，浙大一院普外科还没有明确分设亚专科。作为乳腺疾病，在外科中微不足道。外科医生也不重视影像检查，很多乳房肿块，往往是通过医生手诊就直接手术了。
作为一名女性，傅佩芬深深地明白乳房作为第二特征对于一个女性的重要性。但是大多数女性却清一色地选择了乳房全切术，尽管上世纪70年代左右，国际上就出现了不少“保乳”的声音，但这些“声音”在中国社会中却显得十分渺小、微弱。
作为科室的“女掌门”，傅佩芬尤为注重手术术式的革新。2021年，她带领团队成功开展了新技术：单孔腔镜下乳房切除+假体乳房重建。据傅佩芬介绍，此种术式优势颇多。不同于传统术式，此种术式通过女性腋下身体侧方的隐蔽处作为手术切口，从而完成全乳房完整切除及乳房重建。“如果按照传统的手术方式，不仅会造成女性的乳房缺失，而且极有可能在胸壁上造成几十公分的。但从腋下作为手术切口，就不容易看出”，傅佩芬说。
“不要手上有刀，就乱刀飞舞。”《乳腺癌术后乳房重建中国专家共识》一文中曾提道：“中国整形外科医师严重短缺，其中，能够胜任乳腺癌术后乳房重建的整形外科医师数量根本无力承担巨大的病人群体，也成为影响中国乳房重建规范化进程的瓶颈之一。”
“乳房承载和蕴含的两性关系及使命意义对于一个女性来讲是不言而喻的。在整形医师的短缺下，我们也是提倡手‘无痕’，尽力地向外界发出保乳的‘中国声音’，不要让外界形成一种惯性思维，说到中国的乳腺癌患者，清一色看就是全切术”，傅佩芬告诉我们。