预付款融资通常是基于核心企业的业务进行，核心企业是属于生产型企业，下游采购商给核心企业下订单，需要预支付订单全额，核心企业收到货款后再进行生产。
此时如果采购缺资金情况则无法进行下订单。
在这个基础上，金融机构介入在供应链环节中，提供预付款融资产品。
采购商只需要支付一定比例的保证金，剩余资金由金融机构进行垫付。
在生产完成，货权控制在核心企业手中，采购商在进行提货时，必须先还款给金融机构，金融机构开具放货通知单。
核心企业接收到放货通知单再进行放货。
如果下游采购商违约，则需要由核心协助金融机构处理货物，将货物处置完成后的资金，再还款给金融机构。
预付款融资交易结构（根据金融机构要求会有不同的改动）
预付款融资模式主要是以生产型企业为主，金融机构已经介入到供应链环节中，核心企业协助金融机构完成整个融资流程。
中小企业是供应链融资的直接受益者，他们的资金需求得到解决，生产经营能力得到提升。
将会有助于整条供应链的稳定与，使得核心企业拥有稳定高质量的货源和销售渠道，终惠及核心企业自身；
商业银行是资金的贷出方以及整个融资模式的设计者，是不可或缺的第三方机构。
商业银行的参与使供应链融资更加专业、，加强信息共享，补充流动性。
中小企业作为一种特殊的企业群体，对经济增长贡献具有巨大的作用，但由于其自身规模的限制，融资难已成为中小企业发展普遍存在的一大困境。
中小企业在信贷市场处于不利地位，其根源在于中小企业信用的先天性缺陷和先天性规模小，缺乏同大企业相比的信贷融资所必须的信息优势，金融机构的结构调整并不能提升中小企业整体的信用水平，并不能从根本上克服中小企业在信贷市场上的不利地位。
供应链金融就是针对缺乏固定资产、拥有较多流动资产的中小企业而诞生的金融工具，切合中小企业的融资特点，提升了中小企业的信贷能力，有助于化解其融资困境。相较于成熟的国际市场，供应链金融在国内还处于发展阶段，其产品研发、组织架构、风险控制等方面还需要加强理论和实际研究。